L'ouvrage Mémoires & documents consacré à Ugine mentionne qu'en 1581 un certain André Ouvrier achète à "Noble de Chevron de Thenesouz et à sa femme Louise de Seythenex, une partie des moulins du Mottey et de Bavelin". L'ouvrage évoque aussi un acte de décès de 1730 en lien avec le moulin : "Le 24 septembre 1730, Fçois Chappaz, munier au Mottey, est mort d'une chute qu'il fit à l'entrée des moulins. C'était un très honnête homme. Il a été mon munier pendant 18 ans...".
Deux moulins appartenant au comte d'Ugine sont représentés sur la mappe sarde de 1732 (parcelle 688 et parcelle 691). Le livre des numéros suivis du géomètre précise qu'ils sont tenus en albergement par François Chappaz.
En 1857, le site appartient à Joseph François Porret. Le 2 décembre 1880, il demande l'autorisation de rétablir la prise d'eau endommagée par les crues de 1859, 1870, 1880. Le rapport de visite des lieux de l'ingénieur des Ponts et chaussées de 1881, indique qu'à cette date le moulin des Mottets qui comporte quatre paires de meules, appartient aux frères François et Célestin Dérobert. L'autorisation de rétablir la prise d'eau est accordée le 8 septembre 1881 (FR.AD073, 51SPC10 et FR.AD073, 82S36). En 1883, le moulin fait l'objet de deux saisies immobilières (FR.AD073, 4Q977).
En 1908, le site est acheté par François André. Il est mentionné dans le recensement des moulins de 1917 qui précise que le propriétaire et les ouvriers sont mobilisés et qu'à diverses reprises, la municipalité "a demandé sans jamais l'obtenir la mise en sursis de ce meunier" (FR.AD073, 284 R 1). En 1933, le moulin est modernisé avec le remplacement des meules à farine par des machines à cylindres. En 1951, le fils de François André, Evariste, lui succède. Le moulin fonctionne jusqu'en 1985 exploité par Roland André.
En 2009, la commune d'Ugine acquiert le bâtiment. Celui-ci est actuellement sans affectation.