L'autel est de style éclectique avec une reprise d'éléments issus des modèles paléochrétiens. Une frise de cerfs, rappelant le décor du choeur et évoquant les âmes, orne la partie haute du tabernacle. Son encadrement comporte deux pélicans mystiques, l'agneau mystique au-dessus de la porte disparue, ainsi que deux béliers en partie basse. Le registre supérieur de l'autel, situé de part et d'autre du tabernacle, présente un décor de colombes alternées de canthares, placés au-dessus des scènes figurées sous deux séries de quatre arcatures. A gauche est figurée l'Entrée du Christ à Jérusalem : quatre personnages répartis en deux paires tiennent des rameaux, puis est montré le Christ sur son âne et enfin deux personnages étalant des vêtements sur son chemin. A droite est présentée la Vierge à l'Enfant adorée par les Rois mages suivis de deux bergers reconnaissables à leur houlette et d'un troisième, tête nue, portant l'agneau. Au registre inférieur, des anges en ronde-bosse avec les instruments de la Passion alternent avec des scènes en bas-relief : de gauche à droite : un ange avec les clous, la Mise au Tombeau, un ange avec le fouet de la Flagellation, les Pèlerins d'Emmaüs, un ange tenant la couronne d'épines, les saintes femmes au Tombeau et un ange tenant la lance. Le décor se prolonge sur chacune des élévations latérales, un ange en ronde-bosse (ange de la prière) tient un voile avec à l'ouest la représentation du serpent d'airain et à l'est du serpent et de la pomme. Entre le 12 juillet et le 5 octobre 2011, de nouvelles dégradations ont été commises (revers de l'autel entièrement tagué) ; la situation de l'édifice rend tout état des lieux rapidement obsolète.