Les comptes de châtellenie de Duingt mentionnent à partir 1329 un péage prélevé à Verthier. La ferme du péage était payée tous les ans le 8 septembre jour de la Nativité de Notre Dame (NB la chapelle de Verthier est sous le vocable de Notre-Dame-de-la-Nativité). On peut donc considérer que le pont remonte au moins à cette date puisque seule la traversée de l'Eau-Morte justifiait un péage à Verthier et qu'aucun gué ou bac n'est évoqué dans les archives. En 1635, Maurice Barfelly (procureur fiscal au conseil de Genevois) décrit un pont de pierre sur l'Eau-Morte au bout du lac d'Annecy. Au XIXe s, le peintre Prosper Dunant (Lathuile 1790-Annecy 1878) peint le pont. Il apparaît en dos d'âne et bordé de murets en garde-corps. En 1841 et 1842, le parapet du pont est refait avec de la pierre de Doussard et de la chaux de Cons-Sainte-Colombe. Six chasse-roues sont alors installées. En 1933 le tablier est arrasé et les chasse-roues supprimées. Le site est inscrit en 1943, peu après la destruction d'un autre pont en aval. Le vieux pont de Verthier est finalement inscrit sur la liste supplémentaire des Monuments Historiques le 20 août 1974.